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高新技术企业认定专项审计指引是一项重要的政策文件，旨在规范和指导高新技术企业认定工作中的审计工作。该指引的发布对于提升高新技术企业认定工作的规范性、科学性和公正性具有重要意义。
该指引明确了高新技术企业认定的审计要求和程序。根据该指引，高新技术企业认定工作必须进行审计，确保认定过程的公正性和准确性。审计人员需要对企业的基础设施、研发能力、创新成果等进行全面、客观的评估，确保认定结果的科学性和可靠性。
该指引强调了审计人员的专业素养和道德要求。审计人员必须具备扎实的专业知识和丰富的实践经验，熟悉高新技术企业认定的相关政策和法规，确保审计工作的准确性和可信度。审计人员还要遵守职业道德规范，保持中立、公正的态度，杜绝任何损害认定公正性的行为。
该指引明确了审计结果的使用范围和目的。审计结果应当作为高新技术企业认定的参考依据，并为政府部门和相关利益相关方提供信息支持。审计结果也应当作为企业自身发展的参考，帮助企业发现和解决问题，提升创新能力和核心竞争力。
该指引还强调了信息安全和保密的要求。审计人员应当妥善保管企业提供的相关信息和数据，确保信息安全和保密。审计人员在审计过程中要严格遵守保密协议，杜绝信息泄露。
高新技术企业认定专项审计指引的发布对于规范和指导高新技术企业认定工作具有重要意义。它明确了审计要求和程序，强调了审计人员的专业素养和道德要求，明确了审计结果的使用范围和目的，同时也加强了信息安全和保密的要求。相信在指引的指导下，高新技术企业认定工作将进一步提升其科学性、规范性和公正性。
高新技术企业认定专项审计指引
高新技术企业认定专项审计，是指注册会计师接受拟向有关部门申请进行高新技术企业认定的申报企业委托，对其近三个会计年度（实际经营不满三年的按实际经营年限）的研究开发费用结构明细表和近一个会计年度的高新技术产品（服务）收入明细表进行审计，并出具专项审计报告。
如果申报企业近三个会计年度的财务报表（含资产负债表、损益表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限）未经会计师事务所审计，应同时委托进行财务报表审计。此外有以下情况的，都需要进行高新技术企业认定专项审计：
①凡拟向有关部门申请进行高新技术企业认定的企业，均需要进行高新技术企业认定专项审计。
②由于高新技术企业资格自颁发证书之日起有效期为三年，期满前三个月内企业应提出复审申请，不提出复审申请或复审不合格的，其高新技术企业资格到期自动失效。
所以凡拟向有关部门申请进行高新技术企业复审的企业，均需要进行高新技术企业认定专项审计。
高新技术企业认定专项审计实务
1、由于材料比较繁杂，欲申请认定为高新技术企业，应尽量提早准备；2、应按照《工作指引》的要求，仔细对照检查是否符合认定条件；3、出具研发费用专项审计报告和高新技术产品（服务）收入专项审计报告时，注意选择经认定主管部门备案的会计师事务所，且研发项目和销售合同必须属于企业的主营业务领域。4、所有提供的材料的证据必须提供足够的、有说服力的佐证材料，例如：知识产权证明的所有人必须是申请企业，必须在有效期内等。我单位多年从事高新技术企业认定，有丰富的经验，保证企业通过高新技术企业
高新技术企业认定专项审计
一、专项审计报告必须加盖骑缝章或每页加盖审讫章，同时专项审计报告的附表亦应加盖中介机构审讫章。
二、专项审计报告要求审计以下内容：
（一）近一个会计年度高新技术产品（服务）收入
1.
高新技术产品（服务）收入及其分项明细（见附表1）；
2.
技术性收入及其分项明细(包括：技术转让收入、技术承包收入、技术服务收入、接受委托科研收入等)（见附表1）；
3.
高新技术产品（服务）收入与技术性收入之和；
4.
高新技术产品（服务）收入与技术性收入之和占企业当年总收入的比例。
（二）近三个会计年度的研发费用分年度分项审计
1.
近三个会计年度的研发总费用、在中国境内发生的研究开发费用总额；
2.
近三个会计年度的研究开发费用总额占销售收入总额的比例；
3.
研究开发经费及其分年度分项明细（见附表2）。
三、专项审计报告要求对企业编制的附表1、附表2、附表3及编制说明发表专项审计意见。
四、中介机构应对企业高新技术产品（服务）收入及研发费用情况汇总表（见附表3）中企业填报的“销售收入”、“总收入”及其它指标的真实性和准确性予以重点复核。
注：专项审计报告总体要求按照《高新技术企业认定管理工作指引》，另可参照《高新技术企业认定专项审计指引》（会协[2008]83号）的有关规定执行。
高新技术企业认定需要哪些审计报告
高新技术企业复审需要的材料如下：
1.高新技术企业认定申请书。2.近三年开展研究开发等技术创新活动的报告3.企业营业执照副本、组织机构代码证和税务登记证复印件。4.经具有资质并符合《工作指引》相关条件的中介机构鉴证的企业近3个会计年度研究开发费用和近1个会计年度高新技术产品（服务）收入的专项审计报告。5.经具有资质的中介机构鉴证的企业近3个会计年度的财务报表（含资产负债表、利润及利润分配表、现金流量表）。6.技术创新活动证明材料，包括知识产权证书，各级政府科技立项文件等研究开发项目立项证明，生产批文、新产品或新技术证明（查新）材料、产品质量检验报告等科技成果转化证明，研发组织管理水平证明，以及其他相关证明材料。7.企业职工人数、学历结构以及研发人员占企业职工的比例说明
。8.提交近一个月（季）度的《企业所得税月（季）度预缴纳税申报表》（复印件）
发明专利一个或6个实用新型或6个软件著作权
复审需提前三个月提交申请及上报资料
高新技术企业认定管理工作指引
（一）认定
1．自我评价。企业应对照《认定办法》第十条进行自我评价。认为符合条件的在“高新技术企业认定管理工作网”进行注册登记。
2．注册登记。企业登录“高新技术企业认定管理工作网”，按要求填写《企业注册登记表》（附1），并通过网络系统上传至认定机构。
认定机构应及时完成企业身份确认并将用户名和密码告知企业。
3．准备并提交材料。企业根据获得的用户名和密码进入网上认定管理系统，按要求将下列材料提交认定机构：
（1）《高新技术企业认定申请书》（附2）；
（2）企业营业执照副本、税务登记证书（复印件）；
（3）经具有资质并符合本《工作指引》相关条件的中介机构鉴证的企业近三个会计年度研究开发费用（实际年限不足三年的按实际经营年限）、近一个会计年度高新技术产品（服务）收入专项审计报告；
（4）经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务报表（含资产负债表、利润及利润分配表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限）；
（5）技术创新活动证明材料，包括知识产权证书、独占许可协议、生产批文，新产品或新技术证明（查新）材料、产品质量检验报告，省级（含计划单列市）以上科技计划立项证明，以及其他相关证明材料。
4．组织审查与认定
（1）认定机构收到企业申请材料后，按技术领域从专家库中随机抽取不少于5名相关专家，并将电子材料（隐去企业身份信息）通过网络工作系统分发给所选专家。
（2）认定机构收到专家的评价意见和中介机构的专项审计报告后，对申请企业提出认定意见，并确定高新技术企业认定名单。
上述工作应在收到企业申请材料后60个工作日内完成。
5．公示及颁发证书
经认定的高新技术企业，在“高新技术企业认定管理工作网”上公示15个工作日。公示有异议的，由认定机构对有关问题进行查实处理，属实的应取消高新技术企业资格；公示无异议的，填写高新技术企业认定机构审批备案汇总表，报领导小组办公室备案后，在“高新技术企业认定管理工作网”上公告认定结果，并由认定机构颁发“高新技术企业证书”（加盖科技、财政、税务部门公章）。
具体认定流程如下图所示：
6.高新技术企业资格自颁发证书之日起生效，有效期为三年。
（二）复审
1．高新技术企业资格期满前三个月内企业应提出复审申请（复审申请书同附2），不提出复审申请或复审不合格的，其高新技术企业资格到期自动失效。
2．高新技术企业复审须提交近三个会计年度开展研究开发等技术创新活动的报告，经具有资质并符合本《工作指引》相关条件的中介机构出具的近三个会计年度企业研究与开发费用、近一个会计年度高新技术产品（服务）收入专项审计报告。
复审时应对照《认定办法》第十条进行审查，重点审查第（四）款。对符合条件的企业，按照第十一条（四）款进行公示与备案，并由认定机构重新颁发“高新技术企业证书”（加盖科技、财政、税务部门公章）。
通过复审的高新技术企业资格自颁发“高新技术企业证书”之日起有效期为三年。有效期满后，企业再次提出认定申请的，按初次申请办理。
（三）申请享受税收政策
1.认定（复审）合格的高新技术企业，自认定（复审）当年起可依照《企业所得税法》及《中华人民共和国企业所得税法实施条例》（以下称《实施条例》）、《中华人民共和国税收征收管理法》（以下称《税收征管法》）、《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》（以下称《实施细则》）和《认定办法》等有关规定，申请享受税收优惠政策。
2.未取得高新技术企业资格或不符合《企业所得税法》及其《实施条例》、《税收征管法》及其《实施细则》，以及《认定办法》等有关规定条件的企业，不得享受税收优惠。
（四）复核
对高新技术企业资格及其相关税收政策落实产生争议的，凡属于《认定办法》第十四条、第十五条情况的企业，按《认定办法》规定办理；属于对是否符合第十条（四）款产生争议的，应组织复核，即采用企业自认定前三个会计年度（企业实际经营不满三年的，按实际经营时间）至争议发生之日的研究开发费用总额与同期销售收入总额之比是否符合《认定办法》第十条（四）款规定，判别企业是否应继续保留高新技术企业资格和享受税收优惠政策。
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